遺伝情報処理ソフトウェア GENETYX Ver.13 は、
多彩な機能、見やすい画面、直感的に操作が可能な総合遺伝子解析ソフトウェアです。
核酸・アミノ酸配列入力編集、核酸・アミノ酸配列解析、インターネット検索支援、
論文作成支援、シーケンスアセンブラー、次世代シーケンサー対応機能、配列データベース、
ゲノムマップ等多岐にわたる解析内容をご利用いただけます。
GENETYX Ver.13 の機能
●印は GENETYX Ver.13 で機能アップされた項目です。
核酸・アミノ酸配列入力編集
- ●配列エディタ
- 核酸・アミノ酸配列入力編集
- 核酸・アミノ酸配列の音声出力
- Feature Table 編集機能
- 解析結果のマップ表示
- 複数配列エディタ
核酸・アミノ酸配列共通解析
核酸配列解析
- ●SNPs 検索
- ●リファレンス配列に対しクエリ配列をマッピングし異なる部位を強調表示
- ●クエリ配列に波形を表示可能
- ●アミノ酸配列への翻訳
- 配列データの組成分析
- 特許出願フォーム出力
- GC 含量分布図作成処理
- di-Nucleotide 含量分布図作成処理
- ダイレクトリピート部位の解析
- インバーテッドリピート部位の解析
- 制限酵素認識部位解析
- 制限酵素地図作成
- 高速制限酵素解析
- サイレント変異導入設計支援
- ORF の解析
- コドンフレーム別含量分布図作成処理
- プロモーター部位の解析
- ●PCR プライマー部位の解析
- Primer3
- ハイブリダイゼーション機能
- tRNA 領域の解析
- ヘアピン構造部位の解析
- パリンドローム部位の解析
- RNA 二次構造予測
- siRNA ターゲット部位予測
- エクソン部位検索
- コドン頻度表を使ったコード領域予測
- Fickett 法を使ったコード領域予測
- CpG island 候補検索
- 5' 3' Splice 部位候補検索
- Polymerase II Promoter 部位候補検索
- PolyA signal 候補検索
- cRNA プローブ検索
- ●MUMmer
- ●ゲノムレベルのアライメント機能
アミノ酸配列解析
- 配列データの組成分析
- シグナルペプチドの予測
- 配列組換え機能
- タンパク質の等電点予測
- 核酸配列への逆翻訳
- 特許出願フォーム出力
- PEST 配列検索
- タンパク質の親水性/疎水性表示
- タンパク質の疎水性クラスター解析
- エドモンソンホイールプロットによる構造表示
- タンパク質のヘリックス構造展開表示
- T 細胞抗原性部位の予測
- アミノ酸配列からの制限酵素の解析
- ペプチダーゼ処理
- タンパク質の二次構造予測 (Chou-Fasman)
- Conformational Profile (Chou-Fasman)
- タンパク質の二次構造予測 (GOR)
インターネット検索支援
論文作成支援
- プラスミド地図作成
- 環状
- 線状
シーケンスアセンブラー (ATGC)
- ●
核酸配列自動結合
- 波形のサポート
- コンティグマップ、波形画面、アライメント画面の連動表示
- トリミング処理
配列データベース
次世代シーケンサー対応機能 (GENETYX-Genome)
- 対応形式 : fastq, fna/qual, csfasta
- ●マッピング機能
- ●BAM/SAM 形式データ読み込み機能
- ペアエンドマッピング
- 複数の染色体別に同時マッピング
- 参照配列の Feature の表示
- 変異表の CSV 出力、印刷
-
De Novo Assembly (64bit OS での利用を推奨)
- Forge を利用
- 10Mbp のゲノムのアセンブリに 4GB のメモリが必要
ゲノムマップ (G-MAP)
※ ClustalW は製品に含まれておりません、別途インターネットで入手する必要があります。
SNPs 検索
シーケンスアセンブラー
マルチプルアライメント
分子進化系統樹
GENETYX Ver.13 追加、機能アップされた項目
- SNPs 検索機能
- リファレンス配列に対しクエリ配列のマッピングを行い異なる箇所を強調表示可能
- クエリ配列に波形データを指定すると波形を表示可能
- MUMmer
- ゲノムレベルのアライメント機能
- Primer
- Tm 値、自由エネルギー、二次構造、ダイマーの確認機能
- プロジェクトウィンドウ
- レイアウト切り替え機能
- カーソル位置を任意の番号に変更可能
- PCR プライマー部位の解析
- Specificity Check を最大 8 塩基から最大 15 塩基まで拡張可能
- Translate to AA
- アミノ酸翻訳の表示位置を任意に変更可能
- Entrez 検索
- コンティグ形式のデータをダウンロードするとき配列全体を取得可能に
- 次世代シーケンサー対応機能 (GENETYX-Genome)
- マッピングの高速化
- BAM / SAM インポート時のメモリ使用量の削減により大容量のデータマッピングに対応 (※ GENETYX Ver.12 比較)
- シーケンスアセンブラー (ATGC)
- コンティグを先頭から一定間隔 (3bp,10bp 等) ごとに空白で区切りブロック表示が可能
DEMO 版取得先
MUMmer
プロジェクトウィンドウ
次世代シーケンサー対応機能
動作環境
| 対応機種 | Microsoft Windows 10 / 8.1 / 8 / 7 が動作する機種 |
|---|---|
| OS | Microsoft Windows 10 / 8.1 / 8 / 7 ※以上全て日本語版、32bit OS / 64bit OS |
| メモリ | 1GB 以上 (推奨 2GB 以上) De Novo Assembly は 64bit OS / メモリ 4GB 以上での利用を推奨 |
| HDD 容量 | 1GB 以上の空き容量 |
| その他 | 音声出力にはサウンドカードが必要 |
| Internet Explorer Ver.11 以上がインストールされていること。 |
多年にわたる充実したサポート
| Web サービス | GENETYXホームページ http://www.genetyx.co.jp/ |
|---|---|
| 弊社ホームページより新着情報、製品情報、FAQ、demo版、最新アップデート情報、最新アップデートファイル取得可 | |
| メールサービス | メールでのお問い合わせに対する回答 |
| 電話・FAX サービス | 電話・FAX にてのお問い合わせに対する回答 |
| DM サービス | 登録者にダイレクトメールにて新製品情報等の提供 |
| 年間利用料 | 年間の利用料金はかかりません |
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