GENETYX-MAC (Ver.17)

遺伝情報処理ソフトウェア/Macintosh版

お得な特典あり 平成24年10月1日発売

遺伝情報処理ソフトウェア GENETYX-MAC (Ver.17) は、核酸・アミノ酸入力編集、核酸・アミノ酸配列解析、インターネット検索支援、論文作成支援、シーケンスアセンブラー、次世代シーケンサー対応機能、配列データベース、ゲノムマップ等多彩な機能、優れた操作性を持つ BIO BIG BANG を担う遺伝子解析ソフトウェアです。

GENETYX-MAC (Ver.17) で追加・機能アップされる項目

OS X 10.8 Mountain Lion 対応

次世代シーケンサー対応機能

  • 対応形式 : fastq, fna/qual, csfasta
  • マッピング機能
  • BAM / SAM 形式データ読み込み機能
  • 64bit OS 対応
  • ペアエンドマッピング
  • 複数の染色体別に同時マッピング
  • 参照配列の Feature の表示
  • 変異表の CSV 出力、印刷
  • マッピング結果の印刷
  • De Novo Assembly (64bit OS での利用を推奨)
    • Forge を利用 (http://combiol.org/forge/)
    • 10Mbp のゲノムのアセンブリに 4GB のメモリが必要

配列データベース

  • 100kbase 程度の配列であれば一瞬で解析が終了
  • 即座に切断点マップと各制限酵素毎の切断点数をリスト表示

配列エディタ

  • 自動更新機能
    • NCBI Entrez のキーワードを指定
    • 一定時間毎に Entrez 検索を行い新規配列をデータベースに自動追加
  • 更新履歴の記録

プライマー解析 Primer 3 支援

  • Ver.0.6 から Ver.1.1.4 に対応

配列エディタ

  • テンキー入力の復活

特許出願フォーム出力

  • 従来の配列データの整形出力に加え、出願人情報、配列の特徴、文献情報等も整形して出力可能
次世代シーケンサー対応機能(マッピング機能)
配列データベース
プライマー解析 Primer3 支援

核酸・アミノ酸配列入力編集

  • 配列エディタ
    • 核酸・アミノ酸配列入力編集
    • 核酸・アミノ酸配列の音声出力
    • コメント入力編集
    • Feature Table のマップ表示
  • 並列エディタ

核酸・アミノ酸配列共通解析

  • モチーフ検索
  • ローカルホモロジー解析
  • グローバルホモロジー解析
  • マキシマムマッチング
  • マルチプルアライメント
  • Muscle を使ったマルチプルアライメント
  • ClustalW を使ったマルチプルアライメント
  • 系統樹
  • ハープロット
  • ローカル BLAST 検索機能
    • blastall (blastn, blastx, blastp, tblastn, tblastx)
    • bl2seq (blastn, blastx, blastp)

核酸配列解析

  • 各種解析の一括解析一覧表示
  • 配列データ組成分析
  • アミノ酸配列への翻訳
  • 特許出願フォーム出力
  • GC 含量分布図作成処理
  • di-Nucleotide 含量分布図作成処理
  • ダイレクトリピート部位の解析
  • インバーテッドリピート部位の解析
  • 高速制限酵素解析
  • 制限酵素認識部位の解析
  • アミノ酸変異導入設計支援機能
  • ORF の解析
  • コドンフレーム別含量分布図作成処理
  • プロモーター部位の解析
  • PCR プライマー部位の解析
  • プライマー解析 Primer3 支援
  • ハイブリダイゼーション機能
  • tRNA 領域の解析
  • ヘアピン構造部位の解析
  • パリンドローム部位の解析
  • 核酸配列二次構造予測
  • siRNA ターゲット部位予測
  • コドン頻度表を使ったコード領域予測
  • Fickett 法を使ったコード領域予測
  • CpG island の候補検索
  • 5' 3' スプライス部位候補検索
  • Polymerase II プロモーター部位候補検索
  • PolyA Signal 候補検索

アミノ酸配列解析

  • 各種解析の一括解析一覧表示
  • 配列データの組成分析
  • シグナルペプチドの予測
  • 配列組換え機能
  • 蛋白質の等電点予測
  • 核酸配列への逆翻訳
  • 特許出願フォーム出力
  • 蛋白質の親水性・疎水性表示
  • 蛋白質の疎水性クラスター解析
  • エドモンソン・ホイール・プロット法による蛋白質の構造予測
  • T 細胞抗原性部位の予測
  • アミノ酸配列からの制限酵素の解析
  • ペプチダーゼ処理
  • PEST 配列の検索
  • 蛋白質二次構造予測
    • Chou-Fasman
    • Robson
  • 核酸をアミノ酸に翻訳してのホモロジー解析

シーケンスアセンブラー

  • 波形のサポート
  • コンティグマップ、波形画面、アライメント画面の連動
  • 解析処理
  • トリミング処理
  • 編集機能

配列データベース

  • 配列データベース
    • データベースの作成
    • 配列の登録/削除
    • 検索
    • エントリの配列/並列エディタでの表示
    • BLAST データベースの生成
    • 次世代シーケンサーの解析結果等の fna 形式のファイルのインポート
    • 自動更新機能

論文作成支援

  • プラスミド地図作成(リニア・サーキュラ)

その他

  • NCBI BLAST 検索支援
  • GENETYX-MAC アップデート履歴チェック、アップデータの取得
  • コマンド呼び出し機能

次世代シーケンサー対応機能

  • 対応形式 : fastq, fna/qual, csfasta
  • マッピング機能
  • BAM/SAM 形式データ読み込み機能
  • 64bit OS 対応
  • ペアエンドマッピング
  • 複数の染色体別に同時マッピング
  • 参照配列の Feature の表示
  • 変異表の CSV 出力、印刷
  • マッピング結果の印刷
  • De Novo Assembly
配列エディタ
シーケンスアセンブラー
プラスミド地図作成

多年にわたる充実したサポート

Web サービス GENETYX URL http://www.genetyx.co.jp/
弊社ホームページより新着情報、製品情報、FAQ、最新アップデート情報、最新アップデートファイル取得可
メールサービス メールでのお問い合わせに対する回答
電話・FAX サービス 電話・FAX にてのお問い合わせに対する回答
DM サービス 登録者にダイレクトメールにて新製品情報等の提供
有償年間保守サポート ネットワーク版は常に最新のバージョン利用可

動作環境

対応機種 OS X Lion 以上が動作する IntelMac シリーズ
対応 OS OS X Lion 以上 (Mountain Lion 対応)
メモリ 1GB 以上(2GB 以上を推奨)
HDD 容量 1GB 以上
HFS+ でフォーマットしたもの
(購入時は HFS+ でフォーマットしてあります。その他のフォーマット上では動作しません)