配列エディタ
遺伝情報処理ソフトウェア GENETYX-MAC Ver.18 は多彩な機能、
OS に特化した優れた操作性を持つ総合遺伝子解析ソフトウェアです。
核酸・アミノ酸配列入力編集、核酸・アミノ酸配列解析、インターネット検索支援、
論文作成支援、シーケンスアセンブラー、次世代シーケンサー対応機能、配列データベース、
ゲノムマップ等多岐にわたる解析内容をご利用いただけます。
GENETYX-MAC Ver.18 で追加、機能アップされる項目
OS X 10.10 Yosemite 対応 (OS X 10.9 Mavericks 以上)
MUMmer
- ゲノムレベルのアライメントに対応
プライマー解析 Primer3 支援
- Sequence、Global のパラメータに対応
NCBI Blast
- Megablast に対応
- Query に Division の指定が可能
Local Blast
- Blast+ 対応
- Megablast に対応
Entrez 対応
- NCBI のキーワード検索を利用する際の独自インターフェースを提供、取得したデータを GENETYX に表示可能
シーケンスアセンブラー
- 配列のファイル出力 (multifasta 形式対応)
MUMmer
プライマー解析 Primer3
シーケンスアセンブラー
Blast
Entrez
動作環境
| 対応機種 | OS X Mavericks 以上が動作する IntelMac シリーズ |
|---|---|
| 対応 OS | OS X Mavericks (10.9.5) 以上 |
| メモリ | 1GB 以上（2GB 以上を推奨） |
| HDD 容量 | 1GB 以上 HFS+ でフォーマットしたもの （購入時は HFS+ でフォーマットしてあります。その他のフォーマット上では動作しません） |
| ハード | CD-ROM (DVD-ROM) 装置 (インストール時に使用) |
多年にわたる充実したサポート
| Web サービス | GENETYX URL http://www.genetyx.co.jp/ 弊社ホームページより新着情報、製品情報、FAQ、demo 版、最新アップデート情報、最新アップデートファイル取得可 |
|---|---|
| メールサービス | メールでのお問い合わせに対する回答 |
| 電話・FAX サービス | 電話・FAX にてのお問い合わせに対する回答 |
| DM サービス | 登録者にダイレクトメールにて新製品情報等の提供 |
| 年間利用料 | 年間の利用料金はかかりません |
GENETYX-MAC Ver.18 の主な機能
核酸・アミノ酸配列入力編集
- 配列エディタ
- 並列エディタ
核酸・アミノ酸配列共通解析
- モチーフ検索
- ローカルホモロジー解析
- グローバルホモロジー解析
- マキシマムマッチング
- マルチプルアライメント
- Muscle を使ったマルチプルアライメント
- ClustalW を使ったマルチプルアライメント
- 系統樹
- ハープロット
- ☆ローカル BLAST 検索機能
核酸配列解析
- 各種解析の一括解析一覧表示
- 配列データ組成分析
- アミノ酸配列への翻訳
- 特許出願フォーム出力
- GC 含量分布図作成処理
- di-Nucleotide 含量分布図作成処理
- ダイレクトリピート部位の解析
- インバーテッドリピート部位の解析
- 高速制限酵素解析
- 制限酵素認識部位の解析
- アミノ酸変異導入設計支援機能
- ORF の解析
- コドンフレーム別含量分布図作成処理
- プロモーター部位の解析
- PCR プライマー部位の解析
- ☆プライマー解析 Primer3 支援
- ハイブリダイゼーション機能
- tRNA 領域の解析
- ヘアピン構造部位の解析
- パリンドローム部位の解析
- 核酸配列二次構造予測
- siRNA ターゲット部位予測
- コドン頻度表を使ったコード領域予測
- Fickett 法を使ったコード領域予測
- CpG island の候補検索
- 5' 3' スプライス部位候補検索
- Polymerase II プロモーター部位候補検索
- PolyA Signal 候補検索
- ☆MUMmer
配列データベース
- 配列データベース
- データベースの作成
- 配列の登録
- 検索
- エントリの配列/並列エディタでの表示
- BLAST データベースの生成
- 次世代シーケンサーの解析結果等の fna 形式のファイルのインポート
- 自動更新機能
アミノ酸配列解析
- 各種解析の一括解析一覧表示
- 配列データの組成分析
- シグナルペプチドの予測
- 配列組換え機能
- 蛋白質の等電点予測
- 核酸配列への逆翻訳
- 特許出願フォーム出力
- 蛋白質の親水性・疎水性表示
- 蛋白質の疎水性クラスター解析
- エドモンソン・ホイール・プロット法による蛋白質の構造予測
- T 細胞抗原性部位の予測
- アミノ酸配列からの制限酵素の解析
- ペプチダーゼ処理
- PEST 配列の検索
- 蛋白質二次構造予測
- Chou-Fasman
- Robson
- 核酸をアミノ酸に翻訳してのホモロジー解析
シーケンスアセンブラー
- 波形のサポート
- コンティグマップ、波形画面、アライメント画面の連動
- 解析処理
- トリミング処理
- 編集機能
- ☆ファイル出力
論文作成支援
- プラスミド地図作成（リニア・サーキュラ）
次世代シーケンサー対応機能
- 対応形式 : fastq, fna/qual, csfasta
- マッピング機能
- BAM/SAM 形式データ読み込み機能
- 64bit OS 対応
- ペアエンドマッピング
- 複数の染色体別に同時マッピング
- 参照配列の Feature の表示
- 変異表の CSV 出力、印刷
- マッピング結果の印刷
- De Novo Assembly
インターネット検索支援
- ☆Entrez 検索
- ☆Blast 検索
その他
- GENETYX-MAC アップデータ履歴チェック、アップコマンドの取得
- コマンド呼び出し機能
ClustalW は製品に含まれておりません、別途インターネットで入手する必要があります。
☆印は Ver.18 で新規追加・機能アップされた項目です。
シーケンスアセンブラー
マルチプルアライメント
系統樹
プラスミド地図作成
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