配列ビューワソフトウェア G-MAP はゲノムスケールの巨大な配列データ、膨大なアノテーション情報、解析データ等をデータベースに格納し、注目する情報を整理して効率的に表示するゲノムビューワソフトウェアです。
- ●ゲノム配列ビューワ G-MAP
- G-MAP は、ゲノム配列に関する様々な情報を記録し、表示、編集、検索、解析、印刷などの多彩な用途へ応用可能なゲノム配列ビューワです。
- ●巨大なゲノム配列に対応
- ウィルスゲノムのような短い配列から、ヒトゲノムのような巨大な配列まで、スケーラブルに取り扱うことができます。
- ●アノテーションを整理して記録
- ゲノム配列に付随する様々なアノテーション情報を用途に合わせて分類して管理できます。 研究メモなどの独自データの記録や整理にも便利です。
- ●解析データを取り込んでマップに表示
- 解析ツールや表計算ソフトで作成した様々なデータを取り込み、図形やグラフなどで表示できます。 表示方法は用途に合わせて柔軟にカスタマイズ可能です。
- ●複数配列の並列表示に対応
- 複数のゲノム配列の情報を記録して、並べて表示できます。 配列間の遺伝子領域の比較などが可能です。
- ●扱いやすい操作性
- マップのグラフィック表示、リストの詳細表示、ツリーの分類表示が連動することで、データの操作や表示の切り替えが素早く簡単に行えます。
アノテーションデータの管理
- アノテーションデータのデータベース化
- 対応ファイル形式 (GenBank、EMBL、FASTA、PlainText)
- 巨大な配列データに対応 (100 Mbp オーダー)
- Feature データに対するキーワード検索
- Feature データの編集および追加
- コメントデータの編集および追加
- 各種データのリスト表示と検索
- 配列データのインポート
- データに関連する情報をブラウザへ表示
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☆ 条件指定によるデータ選択
- キーワードや数値などの条件に該当するデータの一括選択
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☆ 解析データの Feature データ変換機能
- 複数の解析データを Feature データへ一括変換して登録
- 翻訳配列を translation に設定可能
ゲノム情報のマップ表示
- 複数のゲノム配列をマップに並列表示
- 表示方向の反転や相対位置の変更
- 柔軟な表示状態の切り替えや並べ替え
- グリッドおよびルーラーの表示
- CDS データの表示
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☆ 条件指定による一括表示設定
- 条件を指定してデータの表示を一括指定
- 条件ごとに個別に表示を指定可能
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☆ カテゴリツリーウインドウ
- ビューを種類ごとに自動的にグループ分け
- グループ単位でビューを一括操作可能
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☆ 標準 Feature ビューの編集
- 標準で作成される Feature ビューをカスタマイズ
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☆ データ比較表示
- 値が一致したデータを線で結んで表示
- 線で結ばれたデータの一括整列
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☆ 解析データのグラフ表示
- 解析データの数値をマップ上にプロット
- 棒グラフ・折れ線グラフ・面グラフに対応
- 積み上げや対数軸指定が可能
- 基準線を設定可能
ゲノム配列の解析
- 相補鎖変換
- アミノ酸配列への 6 フレーム翻訳
- ORF 検索
- 解析データのインポート
- 解析データのエクスポート
マップの印刷
- マップの表示状態をそのまま印刷
- 折り返し印刷
- 拡大縮小印刷
- 印刷のプレビュー機能
- 拡張メタファイルへの出力
動作環境
| 対応機種 | : | Microsoft Windows 10 / 8.1 / 7 が動作する機種 |
|---|---|---|
| 対応 OS | : | Microsoft Windows 10 / 8.1 / 7 ※以上全て日本語版、32bit OS / 64 bit OS |
| メモリ | : | 1GB 以上（推奨 2GB 以上） |
| HDD 容量 | : | 1GB 以上の空き容量 |
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条件指定による一括表示設定
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データ比較表示
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解析データのグラフ表示
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印刷のプレビュー機能
☆印は Ver.2 より追加・変更された機能です。
※別途ネットワーク対応版あり。
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