GENETYX-MAC (Ver.20) 機能説明

PolyA signal 候補検索

Consensus Matrix (Kondrakhin 1994) を基に、PolyA signal (AATAAA、ATTAAA) を検索します。

配列の先頭から終わりまで、1 塩基ずつ移動させながらスコアを計算します。

スコアが閾値より大きい値であれば、PolyA signal を含む領域と予測します。

その領域内に含まれる、AATAAA、または、ATTAAA の配列を PolyA signal と予測しています。