GENETYX Ver.12

遺伝情報処理ソフトウェア/Windows版

NEW 平成25年10月1日発売!

GENETYX Ver.12 は、核酸・アミノ酸入力編集、核酸・アミノ酸配列解析、インターネット検索支援、論文作成支援、シーケンスアセンブラー、次世代シーケンサー対応機能、配列データベース、ゲノムマップ等多彩な機能、優れた操作性を持つ BIO BIG BANG を担う遺伝子解析ソフトウェアです。

GENETYX Ver.12 で追加・機能アップされる予定項目

ホモロジー解析

  • BLAST+ に対応
    • 64bit 版対応
  • 複数の検索結果から一度に配列をエクスポート
    • 出力時に配列全体かアライメントされた領域のみか選択可能
  • 複数配列エディタに出力する時、配列全体かアライメントされた領域のみかを選択可能

インターネット検索支援 (NCBI BLAST)

  • BLAST Results (NCBI BLAST) ウィンドウがアクティブでない場合でも検索を継続

複数配列エディタ

  • フィーチャーの同時表示
  • 配列の背景色の設定
  • 配列の文字色の設定
  • 下線の追加
  • 配列の背景色、配列の文字色、下線をツールバーから簡単設定
  • 配列名に配列データの定義行や生物種の情報を追加して表示可能
  • Muscle に対応
    • 64bit 版対応
  • 差分表示時の基準にコンセンサスを利用可能

配列エディタ

  • 配列の背景色、配列の文字色、下線をツールバーから簡単設定
  • フィーチャーの編集、配列の色、ノートの編集も Undo / Redo 可能
  • Reverse Complement 時に配列の背景色、配列の文字色、下線、フィーチャー、ノートが自動的に追従

PCR プライマー部位の解析

  • Sense Primer, Antisense Primer を独立して設計可能

制限酵素認識部位解析/制限酵素地図作成

  • dam / dcm メチラーゼでメチル化される塩基が含まれている認識部位を強調表示

特許出願フォーム出力 (核酸)

  • 出願人情報、配列の特徴、文献情報等も整形して出力可能

プラスミド地図作成

  • dam / dcm メチラーゼでメチル化される塩基が含まれている認識部位を強調表示
配列エディタ
配列の背景色、配列の文字色、下線をツールバーから簡単設定
複数配列エディタ
フィーチャーの同時表示
プラスミド作図機能
dam / dcm メチラーゼでメチル化される塩基が含まれている認識部位を強調表示

GENETYX Ver.12 機能

核酸・アミノ酸配列入力編集

  • 配列エディタ
    • 核酸・アミノ酸配列入力編集
    • 核酸・アミノ酸配列の音声出力
    • Feature Table 編集機能
    • 解析結果のマップ表示
  • 複数配列エディタ
    • フィーチャーの同時表示
    • 配列の背景色の設定
    • 配列の文字色の設定
    • 下線の追加
    • 配列の背景色、配列の文字色、下線を簡単設定
    • 配列名に配列データの定義行や生物種の情報を追加して表示可能
    • Muscle に対応
    • 差分表示時の基準にコンセンサスを利用可能

核酸・アミノ酸配列共通解析

  • ホモロジー解析
  • グローバルホモロジー解析
  • マルチプルアライメント
    • Clustal W によるマルチプルアライメント
    • Muscle によるマルチプルアライメント
  • 分子進化系統樹
  • ハープロット
  • モチーフ検索
  • ローカル BLAST 検索

次世代シーケンサー対応機能

  • 対応形式 : fastq, fna/qual, csfasta
  • マッピング機能
  • BAM/SAM 形式データ読み込み機能
  • De Novo Assembly

核酸配列解析

  • 配列データの組成分析
  • アミノ酸配列への翻訳
  • 特許出願フォーム出力
  • GC 含量分布図作成処理
  • di-Nucleotide 含量分布図作成処理
  • ダイレクトリピート部位の解析
  • インバーテッドリピート部位の解析
  • 制限酵素認識部位解析
  • 制限酵素地図作成
  • 高速制限酵素解析
  • サイレント変異導入設計支援
  • ORF の解析
  • コドンフレーム別含量分布図作成処理
  • プロモーター部位の解析
  • PCR プライマー部位の解析
  • Primer 3
  • ハイブリダイゼーション機能
  • tRNA 領域の解析
  • ヘアピン構造部位の解析
  • パリンドローム部位の解析
  • RNA 二次構造予測
  • siRNA ターゲット部位予測
  • エクソン部位検索
  • コドン頻度表を使ったコード領域予測
  • Fickett 法を使ったコード領域予測
  • CpG island 候補検索
  • 5'3' Splice 部位候補検索
  • Polymerase II Promoter 部位候補検索
  • PolyA signal 候補検索
  • cRNA プローブ検索

配列データベース

  • データベース構築
  • エントリーの検索更新
  • BLAST 検索
  • キーワード検索
  • 自動更新機能

アミノ酸配列解析

  • 配列データの組成分析
  • シグナルペプチドの予測
  • 配列組換え機能
  • タンパク質の等電点予測
  • 核酸配列への逆翻訳
  • 特許出願フォーム出力
  • PEST 配列検索
  • タンパク質の親水性 / 疎水性表示
  • タンパク質の疎水性クラスター解析
  • エドモンソンホイールプロットによる構造表示
  • タンパク質のヘリックス構造展開表示
  • T 細胞抗原性部位の予測
  • アミノ酸配列からの制限酵素の解析
  • ペプチダーゼ処理
  • タンパク質の二次構造予測 (Chou-Fasman)
  • Conformational Profile (Chou-Fasman)
  • タンパク質の二次構造予測 (Robson)
  • 核酸をアミノ酸に翻訳してのホモロジー解析

インターネット検索支援

  • Entrez 検索
  • BLAST 検索

論文作成支援

  • プラスミド地図作成
    • 環状
    • 線状

シーケンスアセンブラー

  • 核酸配列自動結合
    • 波形のサポート
    • コンティグマップ、波形画面、アライメント画面の連動表示
    • トリミング処理

ゲノムマップ

  • ゲノムマップビューワー
印は GENETYX Ver.12 にて追加・機能アップした項目です。

動作環境

対応機種 Microsoft Windows 8 / 7 / Vista が動作する機種
対応 OS Microsoft Windows 8 / 7 / Vista
※以上全て日本語版、32bit OS / 64bit OS
メモリ 1GB 以上 (推奨 2GB 以上)
※De Novo Assembly は 64bit OS / メモリ 4GB 以上での利用を推奨
HDD 容量 1GB 以上の空き容量
その他 音声出力にはサウンドカードが必要
Internet Explorer Ver.8 以上がインストールされていること。

多年にわたる充実したサポート

Web サービス GENETYX ホームページ http://www.genetyx.co.jp/
弊社ホームページより新着情報、製品情報、FAQ、最新アップデート情報、最新アップデートファイル取得可
メールサービス メールでのお問い合わせに対する回答
電話・FAX サービス 電話・FAX にてのお問い合わせに対する回答
DM サービス 登録者にダイレクトメールにて新製品情報等の提供
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